Diversidad de especies de Candida recuperadas de la cavidad bucal de pacientes oncológicos en Barranquilla, Colombia Candida spp bucal y cáncer / Species diversity of the genus Candida in the oral cavity of cancer patients in Barranquilla, Colombia

Resumen Se caracterizaron especies de Candida recuperadas de la cavidad bucal de pacientes oncológicos en una institución prestadora de salud de Barranquilla, Colombia. La investigación tuvo un diseño de corte transversal, mediante un muestreo a conveniencia se seleccionaron 60 pacientes oncológicos con candidiasis oral. Las muestras obtenidas se cultivaron en agar Sabouraud cloranfenicol, CHROMagar® Candida y agar Sabouraud dextrosa. Los microorganismos aislados se identificaron y se estableció el perfil de sensibilidad a los antifúngicos. Se aplicó estadística descriptiva, prueba de X 2 y análisis bivariado utilizando el programa Statgraphics Centurión XVII, con razón de momios (OR) para probabilidad de ocurrencia. Se identificaron un total de 107 cepas de Candida correspondientes a 15 especies, distribuidas del siguiente modo: C. albicans 23%, C. glabrata 18%, C. tropicalis 13%, C. krusei 10%, C. intermedia y C. lipolytica con 1,5%. En 77% de los casos estuvieron implicadas especies diferentes de C. albicans. Se identificó la existencia de relación entre cáncer del sistema reproductor y C. guilliermondii (p = 0,0001, < 0,05; OR 17) y entre C. colliculosa y cánceres respiratorios (p = 0,0003 < 0,05; OR 19,5). El 99% de las especies de Candida identificadas fueron sensibles a los antifúngicos: fluconazol, voriconazol, caspofungina y micafungina. Solo una cepa de C. krusei fue resistente. Se concluye que existió diversidad de especies de Candida en la cavidad bucal de pacientes oncológicos, ya sea como colonizantes únicos o en combinación, de modo que más de una especie de Candida podría ser responsable de la infección micótica en la cavidad bucal de estos enfermos.

Abstract Candida spp. was characterized in the oral cavity of cancer patients in a health care center in Barranquilla, Colombia. This is a cross-sectional investigation including 60 oncological patients with oral candidiasis, selected by convenience sampling, from whom samples were subjected to culture in Sabouraud chloramphenicol agar, CHROMagar® Candida and Sabouraud dextrose agar were taken. The antifungal susceptibility profile was then identified and established. Descriptive statistics, Chi square test, and bivariate analysis were conducted using the Statgraphics Centurion XVII software with odds ratio (OR) for the probability of occurrence. A total of 107 Candida strains were identified belonging to 15 species, C. albicans with 23%, C. glabrata with 18%, C. tropicalis 13%, C. krusei 10%, C intermedia, and C. lipolytica with 1.5%. Species other than C. albicans were identified in 77% of the cases. A relationship between reproductive system cancer and C. guilliermondii was identified (p = 0.0001, <0.05) OR: 17.0. Between C. colliculosa and respiratory cancer (p = 0.0003, <0.05) OR 19.5. With regard to antifungal susceptibility, 99% of the identified Candida species were susceptible to the following antifungals: fluconazole, voriconazole, caspofungin, and micafungin. Only one strain of C. krusei was resistant. It is concluded that there was a diversity of Candida species, either single or mixed in cancer patients, which could determine that only one species is not responsible for fungal infection in the oral cavity.

Candidiasis bucal en pacientes con cáncer sometidos a quimioterapia / Oral candidiasis in patients undergoing cancer chemotherapy

RESUMEN Introducción: Algunos tipos de cáncer suelen ser tratados con fármacos quimioterapéuticos que afectan de forma indirecta la cavidad bucal, los cuales susceptibilizan al paciente a contraer infecciones bucales como candidiasis bucal. Se ha evidenciado que una condición oncológica facilita una infección bucal por Candida albicans, sin embargo, otras especies de Candida se les relaciona poco. Objetivo: Identificar especies de Candida spp. en cavidad bucal de pacientes sometidos a quimioterapia. Métodos: Estudio descriptivo de corte transversal. Se tomaron 60 muestras de igual número de pacientes por conveniencia de un Instituto Oncológico en Barranquilla, Colombia. Previo a un examen clínico de diagnóstico de candidiasis bucal. Se tomaron hisopados en las superficies infectadas para realizar un examen directo -tinción de Gram y cultivo en agar dextrosa Sabouraud con cloranfenicol incubadas a 37 ºC durante 48 h y posteriormente cultivadas en medio CHROMagar® Candida- para identificación de diferentes especies. Se aplicó estadística descriptiva y de correlación. Resultados. El 55 por ciento de los pacientes correspondió al sexo femenino, con edades mayores a 60 años. El cáncer de mama fue el más frecuente en el 30 por ciento. La quimioterapia aplicada a todos fue el 5-fluorouracilo combinado con ciclofosfamida. El tipo clínico de candidiasis atrófica en lengua fue más frecuente en el 37 por ciento, seguida de candidiasis pseudomembranosa en lengua en el 33 por ciento. El 90 por ciento de muestras presentó algún tipo de Candida, crecimiento de una única especie y cultivos mixtos con más de una especie de Candida. Se evidenció el 13,3 por ciento de C. albicans y otro 13,3 por ciento de Candida spp. no albicans. Ninguno de los diagnósticos oncológicos tuvo una asociación estadísticamente significativa con las especies de Candida. Conclusiones: Se evidencia que la especie de C. albicans en candidiasis bucal en pacientes con cáncer, fue la más frecuente, con predominio en mayor proporción cultivos mixtos de Candida no albicans (C. glabrata, C. tropicalis) poco relacionados con este tipo de enfermedad(AU)

ABSTRACT Introduction: Some types of cancer are often treated with chemotherapeutic drugs which indirectly affect the oral cavity, thus making the patient vulnerable to infections such as oral candidiasis. Oral infection by Candida albicans has been found to be fostered by oncological conditions, but other Candida species have not been sufficiently analyzed in such a context. Objective: Identify Candida spp. in the oral cavity of patients undergoing cancer chemotherapy. Methods: A descriptive cross-sectional study was conducted of 60 samples of an equal number of patients selected by convenience sampling at an Oncological Institute in Barranquilla, Colombia, following diagnostic clinical examination for oral candidiasis. Swab samples were taken from the infected surfaces to perform direct examination - Gram staining and Sabouraud dextrose agar culture with chloramphenicol incubated at 37ºC for 48 h and then cultured in CHROMagar® Candida medium - for identification of various species. Analysis was based on correlation and descriptive statistics. Results: Of the total patients evaluated 55 percent were female and aged over 60 years. Breast cancer prevailed with 30%. The chemotherapy applied in all cases was 5-fluorouracil combined with cyclophosphamide. Atrophic candidiasis of the tongue was the most common clinical type with 37 percent, followed by pseudomembranous candidiasis of the tongue with 33 percent. Of the samples examined, 90 percent contained some sort of Candida, growth of a single species and mixed cultures with more than one Candida species. C. albicans represented 13.3 percent and non-albicans spp. another 13.3 percent. None of the oncological diagnostic analyses had a statistically significant association to Candida species. Conclusions: The species C. albicans was the most commonly found in oral candidiasis among cancer patients, with a predominance of non-albicans Candida spp. (C. glabrata, C. tropicalis) mixed cultures, a fact not generally related to this condition(AU)

Evaluación de un método de amplificación isotérmica mediado por bucle para la detección rápida del virus sincicial respiratorio en niños con infección respiratoria aguda / Evaluation of a loop-mediated isothermal amplification method for the rapid detection of human respiratory syncytial virus in children with acute respiratory infection

Resumen Introducción. El virus sincicial respiratorio humano (hRSV) es la causa más frecuente de infección respiratoria aguda de las vías respiratorias inferiores en niños menores de cinco años. El desarrollo de técnicas moleculares para identificarlo es uno de los retos actuales en el campo de la investigación clínica. Objetivo. Evaluar un método de amplificación isotérmica para la detección rápida del hRSV en niños con infección respiratoria aguda. Materiales y métodos. Se extrajo el ARN viral de 304 muestras de hisopado nasal en niños con síntomas de infección respiratoria aguda atendidos en el servicio de urgencias del Hospital de la Universidad del Norte en Barranquilla entre abril del 2016 y julio del 2017. Se evaluó la prueba de amplificación isotérmica mediada por bucle mediante transcriptasa inversa de la proteína de la matriz (M) (Reverse Transcription Loop-Mediated Isothermal Amplification, RT-LAMP) comparada con técnicas moleculares como la reacción en cadena de la polimerasa mediante transcriptasa inversa múltiple anidada (Reverse Transcription- Polymerase Chain Reaction, RT-PCR), la cual se empleó como la prueba estándar, la PCR en tiempo real (quantitative PCR, qPCR) y la RT-LAMP de la proteína L (L) para la detección rápida del virus sincicial respiratorio (VSR), subtipo A y subtipo B. Resultados. La prueba de RT-LAMP (M) tuvo una sensibilidad de 93,59 %, una especificidad de 92,92 % y una concordancia de 0,83 ± 0,036 comparada con la prueba de RT-PCR anidada. El índice kappa del RT-LAMP (M) fue superior, y los valores del RT-LAMP (L) y la qPCR concordaron (0,75 ± 0,043 y 0,71 ± 0,045, respectivamente). Conclusiones. Estos resultados indican que la prueba RT-LAMP (M) puede considerarse como una herramienta de utilidad clínica para detectar el hSRVA, dado que el tiempo requerido para la obtención de resultados, así como los costos, es menor, y su desempeño es mejor que el de las otras pruebas moleculares evaluadas.

Abstract Introduction: Human respiratory syncytial virus (hRSV) is the most frequent cause of acute respiratory infection of the lower respiratory tract in children under the age of five. The development of molecular techniques able to identify hRSV is one of the current challenges in the field of clinical research. Objective: To evaluate the ability of an isothermal amplification method to rapidly detect hRSV in children with acute respiratory infection. Materials and methods: We collected 304 nasopharyngeal swab samples from children with symptoms of acute respiratory infection who attended the emergency unit at Hospital de la Universidad del Norte in Barranquilla from April, 2016, to July, 2017. After extracting viral RNA from the samples, we evaluated the ability of the reverse transcriptase-loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) M assay to rapidly detect hRSVA and hRSVB compared to other molecular techniques: quantitative PCR (qPCR), reverse transcriptase-LAMP L assay, and as a standard, the multiplex nested reverse transcriptase polymerase chain reaction (nested RT-PCR). Results: The RT-LAMP M assay had a sensitivity of 93.59% and a specificity of 92.92%, and a concordance of 0.83 ± 0.036 as compared with the nested RT-PCR test. While the Kappa index of the RT-LAMP M assay was higher than the values for the RT-LAMP L assay and the qPCR, the values of the latter two methods were in agreement (0.75 ± 0.043 and 0.71 ± 0.045, respectively). Conclusion: Due to the shorter running times, lower costs and better performance of the RT-LAMP M assay, it can be considered as a useful clinical tool for the detection of RSVA.

Prevalence of potentially pathogenic microbiological agents in vaginal exudates of asymptomatic pregnant women, barranquilla, colombia, 2014-2015 / Prevalencia de agentes microbiológicos potencialmente patógenos en el exudado vaginal de gestantes asintomáticas, barranquilla, colombia, 2014-2015

ABSTRACT Objective: To determine the prevalence of potentially pathogenic microbiological agents in vaginal exudates in a sample of asymptomatic pregnant women in the Department of Atlantico, Colombia. Materials and Methods: Descriptive cross-sectional study of a sample of asymptomatic pregnant women who attended a private primary healthcare institution in Barranquilla, Colombia, between 2014 and 2015. Pregnant women having received antimicrobial treatment within the last 30 days, with vaginal bleeding, mental disability or immunosuppression, were excluded. Consecutive sampling was performed. The prevalence of colonization time by some of the microbiological agents as well as specific prevalence were estimated: number of women with infection by agent type/number of women at risk assessed. Results: Overall prevalence was 24.8% (56/226); 55.4% (31/56) was due to vaginitis causal agents, and 44.6% (25/56) to vaginosis. The specific prevalence by type of pathogen, 13.3% (30/226) was vaginitis due to colonization by Candida spp. and 0.4% (1/226) was vaginitis due to T. vaginalis. Bacterial vaginosis (BV) was found in 8.0% (18/226). Conclusion: Substantial colonization of the lower genital tract by potentially pathogenic germs is found in pregnant women between 35 and 37 weeks of gestation. Further studies are required in order to determine the benefit of population screening in terms of avoiding poor maternal and perinatal outcomes, and the impact on the resulting overcosts.

RESUMEN Objetivo: establecer la prevalencia de agentes microbiológicos potencialmente patógenos en el exudado vaginal de gestantes asintomáticas del departamento del Atlántico, Colombia. Materiales y métodos: estudio de corte transversal descriptivo. Se incluyeron gestantes asintomáticas que acudieron a una institución privada de atención primaria en salud en Barranquilla, Colombia, en 2014 y 2015. Se excluyeron gestantes con tratamiento antimicrobiano en los últimos 30 días, sangrado genital, discapacidad mental e inmunosupresión. Se hizo un muestreo consecutivo no estricto. Se calculó la prevalencia de periodo de colonización por algunos de los agentes microbiológicos y la específica: número de mujeres con infección por tipo de agente/número de mujeres evaluadas en riesgo. Resultados: la prevalencia global fue de 24,8 % (56/226). De estas, el 55,4 % (31/56) fue debido a vaginitis y el 44,6 % (25/56) por vaginosis. La prevalencia específica según tipo de patógenos fue: vaginitis por Candida spp. en 13,3 % (30/226) y por T. vaginalis 0,4 % (1/226). La VB se presentó en 8,0 % (18/226) y una flora intermedia de 3,1 % (7/226). Conclusión: existe una importante colonización del tracto genital inferior de gérmenes potencialmente patógenos en mujeres gestantes de 35 a 37 semanas. Se requieren estudios adicionales para determinar el beneficio de la tamización poblacional en términos de malos resultados maternos perinatales evitados y costos.

Actividad antibacteriana del extracto total de hojas de Cucurbita moschata Duchesne (Ahuyama) / Antibacterial activity of total extract from leaves of Cucurbita moschata Duchesne (ahuyama)

Introduction: Cucurbita moschata Duchesne (ahuyama) is grown across America as well as in the Middle East and Europe. It has been used as alternative medicine since ancient times. In the northern section of the department of Bolívar, Colombia, the plant is used by peasants to treat skin infections, hence our interest in conducting this study. Objective: Evaluate the antibacterial activity of total extract from leaves ofC. moschata against Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli. Methods: Fresh leaves of C. moschata were classified taxonomically using standard methods. The leaves were dried in an oven and pulverized in a blade mill. Extraction was performed by cold solid-liquid percolation and concentration in a rotary evaporator. Antibacterial activity of the ethanolic and hexanic extracts was evaluated in vitro against methicillin-resistant Staphylococcus aureus, Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae, using the minimum inhibitory concentration (MIC) method, in compliance with guidelines from the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Results: The hexanic extract caused significant inhibition from dilution 0.16 µg/mL for S. aureus strain ATCC 43300, and from dilution 19.5 µg/mL for strain ATCC 25923 (MSSA). The ethanolic and hexanic extracts significantly inhibited the growth of the clinical E. coli strain, whereas no significant inhibition was observed for K. pneumoniae at any of the concentrations tested. Conclusions: For the first time it was shown that the total hexanic extract of leaves of C. moschata had the greatest inhibition power against clinical strains of S. aureus and E. coli. The antimicrobial potential of this native species from the Colombian Caribbean has been recognized, and it is recommended to conduct assays with a larger number of human pathogens(AU)

Introducción: Cucurbita moschata Duchesne (Ahuyama) es cultivada en toda América, así como en Medio Oriente y Europa. Es utilizada desde la antigüedad como medicina alternativa. En la zona norte del departamento de Bolívar-Colombia es empleada por los campesinos para tratar infecciones en la piel, lo que generó el interés por desarrollar esta investigación. Objetivo: evaluar la actividad antibacteriana del extracto total de hojas de C. moschata frente a Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae y Escherichia coli. Métodos: hojas frescas de C. moschata fueron clasificadas taxonómicamente de acuerdo a métodos estándares. La obtención de los extractos se realizó por secado en horno, pulverización en molino de cuchilla, extracción por percolación sólido-líquido en frío y concentración en evaporador rotatorio. La actividad antibacteriana de los extractos etanólicos y hexánicos se evaluó in vitro frente a Staphylococcus aureus meticilino resistente, Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae, mediante el método de Concentración Inhibitoria Mínima (CIM), siguiendo los lineamientos establecidos por Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Resultados: el extracto hexánico generó inhibición significativa desde la dilución 0,16 µg/mL para la cepa de S. aureus ATCC 43300. Para la cepa ATCC 25923 (MSSA) el extracto hexánico generó inhibición significativa desde la dilución 19,5 µg/mL. Los extractos etanólico y hexánico inhibieron significativamente el crecimiento de la cepa clínica de E. coli., mientras que para K. pneumoniae no hubo inhibición significativa en ninguna de las concentraciones evaluadas. Conclusiones: se demostró por primera vez que el extracto hexánico total de hojas de C. moschata tuvo el mayor poder de inhibición frente a las cepas clínicas de S. aureus y E. coli. Se reconoce el potencial antimicrobiano de esta especie autóctona de la costa del Caribe colombiano y se recomienda realizar ensayos en un número mayor de patógenos humanos(AU)